A.E. Iraklis (Α.Ε. Ηρακλής) é um clube de futebol profissional grego fundado em 1968 e sediado em Heraclião, Creta. O clube disputa atualmente a Segunda Divisão Grega, correspondente ao segundo escalão do futebol grego.
O A.E. Iraklis foi fundado por um grupo de jogadores amadores locais que queriam criar um clube que representasse a cidade de Heraclião. O clube foi inicialmente chamado de "Heraklion FC", mas mudou seu nome para "A.E. Iraklis" em homenagem ao semideus grego da força, Hércules.
O A.E. Iraklis começou a competir nas divisões inferiores do futebol grego e, na temporada 1979-80, conseguiu o acesso à Segunda Divisão. O clube permaneceu na Segunda Divisão por 12 temporadas, até que foi promovido à Primeira Divisão na temporada 1991-92.
O A.E. Iraklis disputou a Primeira Divisão por cinco temporadas, mas foi rebaixado para a Segunda Divisão na temporada 1996-97. O clube retornou à Primeira Divisão na temporada 2000-01, mas foi rebaixado novamente na temporada 2002-03.
O A.E. Iraklis disputou a Segunda Divisão por 11 temporadas, até que foi promovido à Primeira Divisão na temporada 2013-14. O clube disputou a Primeira Divisão por quatro temporadas, mas foi rebaixado para a Segunda Divisão na temporada 2017-18.
O A.E. Iraklis atualmente disputa a Segunda Divisão Grega e está situado na zona de rebaixamento da tabela. O clube tem sido afetado por problemas financeiros nos últimos anos e está em processo de liquidação.
Apesar dos problemas financeiros, o A.E. Iraklis continua a ser um clube popular em Heraclião e conta com o apoio de uma grande torcida. O clube espera retornar à Primeira Divisão em breve e reconquistar seu lugar entre os principais clubes do futebol grego.
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