A Seleção Sub-20 da Macedônia do Norte representa a Macedônia do Norte em competições internacionais de futebol sub-20. É controlada pela Federação de Futebol da Macedônia, o órgão regulador do futebol na Macedônia do Norte. A equipe compete no Campeonato Sub-20 da UEFA e na Copa do Mundo Sub-20 da FIFA.
A Seleção Sub-20 da Macedônia do Norte não possui títulos internacionais. Sua melhor colocação em um Campeonato Sub-20 da UEFA foi a quarta posição na edição de 2017. Na Copa do Mundo Sub-20, sua melhor colocação foi a participação na fase de grupos na edição de 2017.
Alguns jogadores notáveis que representaram a Seleção Sub-20 da Macedônia do Norte incluem:
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