Medipol Basaksehir

Fundado em 1990, seu antigo nome do clube era ISKI Spor Kulübü e pertencia à empresa de distribuição de água do município. A ISKI competiu nas Ligas Regionais Amadoras na temporada 1990–91 e foi promovida à Segunda Divisão Turca. Após a promoção, o nome do clube mudou para İstanbul Büyüksehir Belediyesi. O clube jogou a TFF 1. Lig até a temporada 1995–96, quando foi rebaixado para a Terceira Divisão Turca.

Após um período de alternância entre o segundo e terceiro escalão do futebol turco, conquistaram por fim o acesso à Süper Lig na temporada 2006–07. Na divisão máxima do futebol turco por 6 temporadas consecutivas, acabou rebaixado para a TFF 1. Lig após terminar o campeonato na 16ª colocação. Entretanto, sua estadia na Segunda Divisão Turca foi breve e logo retornou imediatamente para a Süper Lig na temporada 2013–14.

Em junho de 2014, o clube foi adquirido por novos proprietários alegadamente filiados ao AKP, partido político hegemônico da Turquia, e próximos do atual presidente do país Recep Tayyip Erdogan. Com isso, o nome do clube mudou para İstanbul Başakşehir Futbol Kulübü. Contando agora com maior poderio financeiro e apoio institucional, entrou em uma espiral ascendente, passando a ser bastante competitivo em competições nacionais. Retornando à Süper Lig após vencer a TFF 1. Lig de 2013–14, passou a ter campanhas consistentes na divisão principal do futebol turco, terminando na 4ª colocação na temporada 2014–15, classificando-se pela primeira vez para os playoffs da Liga Europa da UEFA de 2015–16. Na temporada seguinte (2015–16), mais uma 4ª colocação no Campeonato Turco e nova classificação para os playoffs da Liga Europa da UEFA de 2016–17.

Na temporada 2016–17, o clube confirma sua ascensão dentro do futebol turco e se aproxima de grandes conquistas, terminando a temporada como vice–campeão da Copa da Turquia (foi derrotado pelo Konyaspor na disputa por pênaltis por 4–2 após um 0–0 no tempo normal) e do Campeonato Turco (ficou a 4 pontos do Beşiktaş, campeão desta edição). Nesta temporada, classificou-se pela primeira vez para os playoffs da Liga dos Campeões da UEFA de 2017–18.

Nas temporadas seguintes, o clube continuou desempenhando boas campanhas pelo Campeonato Turco, tendo sido 3º colocado na temporada 2017–18, novamente vice–campeão na temporada 2018–19 (ficou a apenas 2 pontos do campeão Galatasaray) e, por fim, sagrou-se campeão da temporada 2019–20 ao terminar a competição com 2 pontos à frente do vice–campeão Trabzonspor. Com esta conquista, o İstanbul Başakşehir passou a figurar na seleta lista dos clubes turcos vencedores da Primeira Divisão Turca, igualando o feito alcançado pelo Bursaspor na temporada 2009–10. Além disso, pela primeira vez em sua história, classificou-se para disputar a fase de grupos da Liga dos Campeões de 2020–21.