O FC Pavlikeni é um clube de futebol profissional búlgaro com sede na cidade de Pavlikeni. O clube atualmente compete na Segunda Liga Búlgara, a segunda divisão do futebol búlgaro.
O clube foi fundado em 1922 e se chamava FC Pavlikeni. Em 1945, o clube foi renomeado para DSO Pavlikeni e, em 1947, foi renomeado novamente para PFC Pavlikeni. Em 1957, o clube foi rebaixado para a liga regional. Em 1961, o clube voltou à segunda divisão e, em 1967, foi nomeado campeão.
Em 1970, o clube foi promovido à primeira divisão, mas foi rebaixado após uma temporada. Em 1974, o clube voltou à primeira divisão e permaneceu lá por quatro temporadas. Em 1978, o clube conquistou o 11º lugar na classificação final, mas isso não foi suficiente para a permanência na primeira divisão.
O clube passou as temporadas seguintes na segunda divisão, até que em 1984 foi rebaixado para a terceira divisão. Em 1986, o clube voltou à segunda divisão e, em 1989, foi promovido à primeira divisão. Em 1990, o clube foi rebaixado para a segunda divisão e, em 1991, foi rebaixado para a terceira divisão.
Em 1994, o clube voltou à segunda divisão e, em 1999, foi promovido à primeira divisão. Em 2001, o clube foi rebaixado para a segunda divisão e, em 2004, foi rebaixado para a terceira divisão. Em 2006, o clube voltou à segunda divisão e, em 2009, foi promovido à primeira divisão.
Em 2010, o clube foi rebaixado para a segunda divisão, onde permanece até hoje.